Ses principales missions furent l' élaboration du nouveau cadre législatif et réglementaire dû à l' ouverture des marchés européens de l' électricité et du gaz et le développement des économies d' énergie et des énergies renouvelables. Michèle Rousseau a ensuite réintégré le Ministère de l' écologie et du développement durable, en qualité de Secrétaire générale, puis à partir de 2008, en qualité de Directrice.